禁忌的愛情(Forbidden Love)
安納金橫衝直撞的個性，也促成了他和艾米達拉(Amidala)的戀情，即使這對絕地武士來說，有這種關係是不被允許的大忌。安納金和艾米達拉在十年後重逢，這時，艾米達拉的生命正受到威脅，她必須把自己交在絕地武士歐比王和他的年輕徒弟手上。
安納金和艾米達拉走得越來越近，日久生情，『這是一個低調，日益茁壯的愛情故事；』強納森海斯說，『這不是那種一見鍾情。當他們剛重逢時，她還只當安納金是個孩子，兩人也有過一些吵嘴，但最後都還是不能抵擋彼此對自己的吸引力。然而這份愛意卻是不被容許的，這個地方很有意思，也比較適合成人觀眾來感受。』。
和安納金一樣，繼續由在『威脅潛伏』出現的娜塔莉波曼飾演的艾米達拉女王，在和他分開了十年以後，也經歷了許多重要的改變。她原先在那卜星的女王時期結束了。對星際事務持續關心的她，現在是共和議會的議員。星際之間一直處在不穩定的動亂狀態，艾米達拉直言不諱的個性和認真，在亂成一團的絕地議會裡，格外引人注意。樹大招風，艾米達拉對事的堅持，讓她成為在系統外勢力日漸龐大的分離主義者的目標，這間接促成了她和歐比王及安納金的重逢。
因為艾米達拉對事業的投入，也因為絕地武士有這麼一個禁止戀愛的信條，她一開始根本不把和安納金之間的戀情放在心上。『艾米達拉的個性很成熟，』娜塔莉波曼說，『她是個理想主義者，誠實又善良；也因為如此，顯得對世事過份天真。艾米達拉並不想陷入愛河，因為她覺得還有更重要的事情等著她去完成。她定位自己將是一個領導者，不能容忍任何軟弱，而正是如此，她反而為情所苦！』。
關連(Connections)
天行者安納金另一段非常重要的關係，是關於他和師傅歐比王肯諾比(Obi-Wan Kenobi)之間，他帶領安納金踏上絕地武士之路。電影對他們友情的探討，是這個傳說故事中最重要的命題之一，也是故事發展的主要線索-一種介乎父子、師徒和師生間的情愫。而正因為安納金和歐比王有這麼濃厚的情誼，才有在『星際大戰：曙光乍現』裡，歐比王忍不住一再對著天行者路克，充滿回憶和想念地談起安納金。
在許多方面，歐比王提供給安納金一個他所沒能擁有過的父親形象。『歐比王和安納金認識很久了，幾乎是從金魁剛（歐比王的師父，『威脅潛伏』中由連恩尼遜飾演）死後，兩人天天在一起。』繼續扮演他在『威脅潛伏』中角色的伊恩麥奎格提醒說，這是亞歷吉尼斯在『經典三部曲』就設定的角色。
伊恩麥奎格對兩人之間不停在調整的互動特別感興趣：歐比王錯估自己可以將安納金訓練到像絕地議會長老、絕地大師尤達一樣；而這個誤判，葬送了安納金，也威脅到整個星際和平。
『複製人全面進攻』說的就是造成之後悲慘亂象的錯誤第一步，儘管歐比王和安納金間擁有亦師亦友的深厚感情，面對師父歐比王嚴格的督促，還是讓安納金感覺處處受限、幾乎要窒息。於是他開始拒絕，甚至反抗這一切。
伊恩麥奎格巧妙地利用他對『經典三部曲』前兩集的感受，來詮釋這種微妙的關係，以及全片的規模和對冒險的追求。『複製人全面進攻』可以說是對於『曙光乍現』(Star Wars: Episode IV - A New Hope)和『帝國大反擊』(Star Wars: Episode V - The Empire Strikes Back)的一種追憶，』他解釋說，『你可以感覺劍拔弩張的氣氛逐漸加溫，可是，有不乏有輕鬆幽默的時刻。電影充滿神秘感的部分也讓我很著迷，就是他這趟調查真相的旅程，讓他到了一個他所不熟悉的次等世界，後街暗巷、小酒吧、以及奇怪的星球。』。
山繆傑克森繼續在『複製人全面進攻』中扮演絕地議會長老--絕地大師魅史雲度(Jedi Master Mace Windu)，他也出聲贊同『複製人進攻』的確延續了『經典三部曲』的奇幻和冒險色彩。『所有看過之前電影的億萬觀眾，都將可以在『複製人全面進攻』中，發現相同的緊張的悖逆關係、緊湊的節奏、精彩的比武對峙以及愛情，』他說，『這會吸引來很多很多人！』。
魅史雲度在『複製人全面進攻』裡角色吃重，在絕地議會佔有一席之地的絕地大師魅史雲度，幾乎與尤達同樣受尊敬、地位相當。隨著由前絕地武士領軍而起、力量強大的分離叛變發生，星際之間日益紛擾動亂；魅史雲度意識到，想和平談判早就為時已晚，該是起身平息亂象的時候了。
在『複製人全面進攻』中，有著一身絕技的魅史雲度，將有許多精彩的動作場面，這正是山繆傑克森期待已久的。『魅史雲度明白大戰即將展開，而他也完全進入備戰狀態！』山繆傑克森說，『我一直都好喜歡看像弗林（以1935年的『布拉德船長』聞名，成為當時好萊塢最突出的強人形象）的電影，現在，我終於也有機會一償宿願，親自上陣演出這些不可思議的場面。』。
另外，歐比王和魅史雲度還遇到其他的共和國的敵人-公認全銀河系最凶猛、功力最高強的賞金獵人。他的姓氏，如同他光可鑒人的盔甲和裝備齊全的飛艇--『奴隸一號』，對星際大戰故事的無數觀眾來說，都是再熟悉不過的了：這個穿著盔甲的殘忍賞金獵人就是強格費特(Jango Fett)，他和他的兒子波巴費特(Boba Fett)關係相當獨特。
波巴費特就是在『帝國大反擊』中，為了贏得赫特族賈霸的懸賞獎金而前去追殺韓所羅的一個賞金獵人，『複製人全面進攻』將會進一步從他最初出現開始說起。（這個角色在『星際大戰：曙光乍現』特別版中，有一段重新介紹他）。『複製人進攻』會講到波巴費特的歷史、自我認同和命運，並描述它如何在接下來的星際衝突中，扮演重要關鍵。我們將會知道他從哪裡來，如何變成我們熟知的惡名昭彰的殺手。扮演年輕波巴費特的14歲演員丹尼爾羅根，和演強格費特的知名紐西蘭演員提米拉莫瑞森，接下將這個賞金獵人家族遺澤在銀幕上呈現的責任。
波巴費特走上他父親的路，這種揉合父子、師徒的密切關連，也帶到另一個剛加入星際大戰世界的角色：杜酷伯爵(Count Dooku)。曾是備受尊敬絕地大師的杜酷伯爵，漸漸不可自拔於共和國裡的動盪景象，於是領軍展開勢力日漸強大的分離叛亂。杜酷伯爵是由尤達一手調教出來的，他再教出金魁剛，而歐比王就是金魁剛的徒弟。所以，被歐比王收入門下的安納金，就是這種絕地武士師徒傳承傳統的第4代。
扮演杜酷伯爵的，主演過膾炙人口吸血鬼系列電影的克里斯多弗李，以其令人毛骨悚然的演繹為觀眾所熟悉。這個氣質特殊且與眾不同的演員，和他在『複製人全面進攻』中的角色，讓人想起『星際大戰：曙光乍現』裡死星的首腦：高級星區首長塔金，這是由克里斯多弗李的同事兼好友-已過世的彼得庫辛飾演。這樣的神似並不是巧合。根據選角指導羅賓葛藍的說法，喬治盧卡斯原先就把克里斯多弗李的角色，設定為『本片的彼得庫辛』；而他一有這個想法時，念頭就轉到了克里斯多弗李。
杜酷伯爵的外形看起來和星際大戰中其他主要壞人角色很不一樣，例如達斯魔或達斯維達(就是以後投靠黑暗勢力的安納金)。可是，杜酷伯爵的高強法力，可是一點都不比這傳說中出現過的任何一股惡勢力遜色。借克里斯多弗李的話，杜酷伯爵，這個老派的高明劍士，有著『用之不竭的生理和心理力量；非常冷漠，活在自己的世界裡，對任何事沒有一點畏懼。有著相當驚人的原力。』。
共和國讓杜酷伯爵感到破滅，是由白卜庭(Palpatine)的勢力日益強盛開始。在『星際大戰首部曲：威脅潛伏』中，那卜星上的貿易禁制和危機，促成白卜庭搖身成為議長。即使他再三保證，共和國還是自此變得混亂和動盪不安。銀河所面臨的新威脅，使銀河議員們決議讓白卜庭延長任期，並承諾他作為最高議長可以掌握的權力。白卜庭接著整合共和國軍隊來保護公民。這裡說的軍隊，是另個和『經典三部曲』密切相關的元素，這個取自『曙光乍現』的對照參考，變成『複製人全面進攻』的核心元素。
伊恩麥可達米繼《絕地大反攻》和《威脅潛伏》，再度扮演白卜庭。繼續用心地在諸多細微之處，表現出這個星際大戰傳奇中（搞不好還是古今中外所有電影中），最邪惡、心機最重的大壞蛋。『白卜庭是個標準的政客，』伊恩麥可達米解釋說，『表面上是那種好好先生，其實骨子裡完全不是這麼一回事！能接演這個角色之所以有趣，因為他本身就是個高明的演員，對那些全心信賴他的人毫不真誠！』。
另外，在『複製人全面進攻』中，重回星際大戰世界懷抱的是，深受大家喜歡的機器人R2-D2和C-3PO。本片中C-3PO的部分會有重大發展。C-3PO在『星際大戰首部曲』時，剛被安納金製造出來，沒有外殼的它勉強只算個半成品。等了10年之後，這個禮儀機器人終於有『像樣』的一天。不過C-3PO還不是我們記得那種『經典三部曲』中很炫的樣子，比較像是一大堆零件拼拼湊湊起來的！
在『複製人全面進攻』中，另一段重要的關係是發生在由澳洲演員喬愛吉頓和波尼皮斯飾演的歐文拉斯和帛露拉斯之間。歐文拉斯在首部曲時有出現過，他是天行者安納金那個老是一臉疲憊的粗魯叔叔，充滿同情心帛露拉斯則是安納金的嬸嬸。歐文和帛露不算有結婚，不過就是在一起。在二部曲時，我們會看到他們和安納金間的關連，然後就能恍然大悟為什麼後來在『曙光乍現』中，他們會那們袒護這個絕地武士的兒子-天行者路克。
歐文的父親Cliegg Lars由知名澳洲演員傑克湯普森演出，也會在安納金的人生旅程中有其影響。而在首部曲出現過的安納金的媽媽Shmi Skywalker，繼續由波妮拉安格斯飾演。
艾美獎得主吉米史麥特則演出奧德藍族的貝爾歐加納議員，這個角色在『曙光乍現』中曾提到，這一次參與了針對要不要成立保護共和國的軍隊的辯論，有吃重的演出。